Techniques de diagnostic pour la Peste des petits ruminants (PPR) Présentiel

La Peste des petits ruminants (PPR) est une infection virale hautement contagieuse affectant les petits ruminants domestiques et sauvages. Dans les zones d'élevage où la maladie est enzootique, elle occasionne des pertes économiques importantes du fait des taux de morbidité et de mortalité parfois élevés. La PPR affecte près d'un milliard de petits ruminants dans le monde.

L'agent étiologique est le PPRV appartenant au genre Morbillivirus, dans la famille des Paramyxoviridae. Le diagnostic sérologique est réalisé de façon classique par ELISA de compétition (cELISA). L'isolement du virus étant difficilement envisageable en moins de trois semaines, l'identification rapide du virus directement à partir d'échantillons de terrain est possible par d'autres méthodes, incluant l'amplification génique, très sensibles et spécifiques.  Il s'agit de la transcription reverse-PCR (RT-PCR), méthode dite conventionnelle et de la RT-PCR en temps réel (rRT-PCR) pour la quantification des charges virales. La RT-PCR conventionnelle produit des matrices suffisamment longues pour permettre le séquençage et l'analyse phylogénétique subséquente.

A  l'issue de cette formation, les participants doivent pouvoir établir un diagnostic dans leur laboratoire, reproduire les techniques apprises, former et encadrer du personnel de laboratoire.

La formation porte sur l'enseignement des différentes méthodes classiques mises en œuvre pour le diagnostic sérologique et le diagnostic moléculaire du virus de la peste des petits ruminants. Cette formation présente des protocoles et des procédures standardisés ainsi que le mode d'emploi des équipements nécessaires.

Les objectifs spécifiques  sont les suivants :

• Formation au diagnostic sérologique de PPRV ;
• Connaissance des méthodes sérologiques de référence de l'OMSA (séroneutralisation et cELISA),
• Formation au diagnostic moléculaire de PPRV ;
• Connaissance des méthodes RT-PCR conventionnelles et en temps réel ;
• Informations sur le séquençage et l'analyse phylogénétique de PPRV.

Cette formation est ouverte aux personnes directement impliquées dans le diagnostic de la PPR (vétérinaires, techniciens de laboratoire).

Sur demande, des sessions délocalisées au sein d'institutions partenaires peuvent être organisées dès lors qu'un nombre suffisant de participants est réuni (au moins 5).

La date ou la durée de la formation peut également être adaptée selon les besoins.

Les candidats doivent en outre maîtriser correctement la langue française ou l'anglais.

 

Les candidatures comprenant un CV détaillé, une lettre de motivation et des indications sur l'organisme de gestion de la bourse, doivent nous être adressées par mail à prisme.formation@cirad.fr, au plus tard un mois avant la date de démarrage (deux mois si le séjour est soumis à l'obtention d'un visa).

• La formation alterne des présentations théoriques et des sessions de travaux pratiques (sérologie, titrage viral, PCR conventionnelle et PCR en temps réel).

laboratoire, matériels nécessaire à la réalisation des objectifs de la formation

 Arnaud BATAILLE, Chercheur virologiste - Expert de la Peste des Petits Ruminants, Cirad UMR ASTRE